重庆市科学技术研究院系2008年由市政府整合原属中央和地方的10个研究院所组建而成的正厅局级事业单位，是集研究开发、中试孵化、成果转化和创新服务为一体的综合性科研机构和地方科学院，是全国省级地方科学院联盟的发起单位和全国科学院联盟的重要成员。现有企事业人员2000多人，设有党建工作处（督查室、院工会）、办公室、干部人事处（人才办）、重科智谷建营办公室、规划发展处（研究室、改革办）、科研管理处（合作办）、资产财务处、纪检监察室等8个内设处室，技术评估、信息与自动化、新材料、低碳环保、生物医药、科技战略研究、大数据研究等7个研究中心（院），科技检测中心、科学咨询杂志社等2家事业单位，高技术创业、自动化仪表、机电设计、光学机械、硅酸盐、日用化工、理化计量、生物技术等8个转（改）制院所，组建市应用技术公司负责转（改）制院所公司和其它65家参控股企业的指导管理。
