厦门大学经济研究所1950年创办。由当时的校长、著名经济学家王亚南倡议和筹划，经教育部批准并直属教育部，是新中国诞生后在高校中建立的第一所，从1950 年到2010年，已有60年历史。 建所六十年以来，一直从事马克思主义经济学、社会主义经济理论与实践的研究，积累了丰富的学术成果与经验，形成南方特色优势，具有很强的理论创新能力，特别是在马克思主义产权理论、社会主义市场经济理论、产业经济理论方面的研究卓有成就，多项研究成果获国家、教育部、福建省大奖，其中两项获“孙冶方经济科学奖”、一项获“五个一工程奖”。研究人员中有曾任和现任国务院学位委员会学科评议组成员。国家社科基金项目评审委员、福建省学位委员会委员、教育部社会科学研究专家咨询委员会委员、教育部邓小平理论研究中心理事、教育部学风建设委员会副主任委员、教育部社会科学委员、经济学部召集人等职.
